可可發酵過程菌種篩選

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Title:	可可發酵過程菌種篩選
Authors:	吳裕仁顏宏愷胡淳怡
Contributors:	健康暨護理學院
Keywords:	可可序列比對
Date:	2016-12
Issue Date:	2020-04-29T05:44:43Z (UTC)
Abstract:	我們從發酵167小時的可可豆樣本中，針對 16S megagenomics區間進行序列定序，共定序出總長度分別為13.1 Mb(CC1)及53.8 Mb(CC2)。結果發現：在CC2樣品序列比對結果發現，數量前三大之OUT菌群與CC1樣品序列分析結果相同，樣品之菌相第一為Acetobacteraceae (醋桿菌)為最大宗，第二為Enterobacteriaceae (腸內細菌)，第三為Paenibacillaceae (類芽孢桿菌)，而三個菌科 OTU總合佔所有 OUT之 97％。屬於發酵前期之乳酸菌至發酵終點時，族群數量變少，故不易篩選。以MRS培養基在厭氧環境下，篩選出的未知菌株，透過 EMB鑑別培養基培養後，出現綠色金屬光澤，以此判定為 E. coli，乳酸菌No1~3皆為 E. coli。後期多以醋酸菌為主發酵， No1, 10, 11皆為醋酸菌，經序列比對為 Acetobacter pasteurianus (100% identities)；而 No 9為G(+)菌 Bacillus thuringiensis (100% identities)。真菌選殖過程中未出現酵母菌，但出現單一綠黴菌，此菌為果腐黴菌，可能可可樹於種植過程中曾遭受真菌感染。
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